锦州医科大学基础医学院的前身为始建于1958年的基础部，1997年正式建院，2011年9月由基础学院更名为基础医学院。基础医学院是学校一个重要的二级教学、科研单位，承担着全院研究生、留学生、本科生、高等职业技术等多层次、多院系学生的专业基础课程的教学及科研工作。

基础医学院现有一级学科2个，二级学科15个，辽宁省重点实验室3个，联合培养博士点1个，硕士点15个，研究方向49个。

基础医学院每学年承担着全校各个层次多个专业（方向）万余学时的教学工作量。近三年来，共获省级教学立项5项，发表国家级、省级教学研究论文50多篇。在“十一五”及“十二五”期间，先后获得1项国家级教学成果，6项省级教学成果，7门省级精品课程，2门省级双语教学示范课程，4个省级优秀教学团队，1个省级实验教学示范中心，2门课程获批辽宁省普通高校本科精品视频公开课建设项目，1门课程获批辽宁省精品资源共享课，主编、参编各类教材77部。1名教师荣获首届全国高等医学院校“青年教师教学基本功大赛”第一名。1名教师荣获第二届全国高等医学院校“青年教师教学基本功大赛”第二名。在辽宁省第十二届软件大赛中获三等奖两项，优秀奖三项。1名教师荣获辽宁省青年教师技能大赛优秀奖。