厦门大学教育研究院具有深厚的历史底蕴。1921年厦门大学建校之初便设有师范部，此后历经教育学部、教育学院、教育学系的变迁，1953年院系调整后保留教育学教研室至1965年。1978年5月17日，潘懋元先生领导创建了厦门大学高等学校教育研究室，1984年2月经教育部批准改为厦门大学高等教育科学研究所，2004年4月6日改为现名。

本院是中国第一个以高等教育学为研究对象的专门研究机构，是中国第一个高等教育学硕士学位授权单位和第一个高等教育学博士学位授权单位，是全国第一个高等教育学国家重点学科所在单位、高等教育研究的国家“985工程”创新基地，依托本单位成立的厦门大学高等教育发展研究中心是全国唯一的专门研究高等教育的教育部人文社科重点研究基地。

本院下设教育理论研究所、教育史研究所、教育经济与管理研究所、比较教育研究所、教育心理研究所等五个研究所。另挂靠有厦门大学考试研究中心、厦门大学高教质量与评估研究所、厦门大学中外合作办学研究中心等研究单位。

本院秉承自强不息、止于至善的校训，努力建设一支高等教育研究的国家队，致力于发展高等教育研究的中国学派，打造国家级高等教育研究智库。现有教职员工40人，其中专任教师31人，包括教授13人、副教授10人和助理教授8人。其中有人文社科资深教授1人，国务院学科评议组成员1人，长江学者特聘教授1人次，闽江学者特聘教授2人次，教育部新（跨）世纪人才5人次，教育部高校青年教师奖获得者2人次，国务院政府特殊津贴4人，福建省高校领军人才3人次，福建省哲学社会科学领军人才4人次，福建省新世纪人才6人次，福建省高校杰出青年科研人才3人次。

本院为教育学一级学科博士授权单位，在高等教育学、教育史、教育经济与管理、比较教育等学科招收和培养博士生，在高等教育学、教育史、比较教育学、课程与教学论、教育经济与管理、发展与教育心理学等学科招收和培养硕士生，是国家首批教育博士（Ed.D.）学位授权单位。本院以培养一流的高等教育研究人才和高等教育领导管理人才为己任，积极探索中国特色的高层次人才培养模式，“学习－研究－教学实践三结合的研究生课程教学方法”获福建省教学成果一等奖，“高等教育学学科建设、人才培养与教学改革咨询”获国家级教学成果奖一等奖，“学术沙龙：情理交融中的人才培养实践”获国家级教学成果二等奖。

作为中国高等教育研究重镇，本院在高等教育基本理论研究、高等教育体制与管理研究、考试制度研究与科举学等领域取得了奠基性的科研成果。先后承担国家和部省级课题100余项，其中教育部哲学社会科学研究重大课题攻关项目3项、国家社会科学基金重点课题7项。研究成果获部省级优秀科研成果奖一等奖17次，其中包括高等学校科学研究优秀成果奖（人文社会科学）一等奖3次、吴玉章人文社会科学一等奖1次、全国教育科学优秀成果奖一等奖3次。研究院还办有《中国高等教育评论》半年刊和《国际高等教育》季刊。

本院以服务社会为宗旨，面向各级政府、教育行政部门和高校，接受委托承担与高等教育相关的重要课题，开展多层次的咨询服务，为各级政府和高校提供政策咨询服务。

本院积极开拓境内外高等教育学术交流与合作，与国内众多大学保持了密切的学术交流关系，与10多所国外知名大学教育研究机构，比如，美国哥伦比亚大学师范学院、英国伦敦大学教育学院高等教育研究中心、荷兰莱顿大学教师教育研究院、俄罗斯国立人文师范大学等签订了学术交流与合作协议，开展了卓有成效的国际合作。

2018年5月17日，本院举行了隆重而热烈的建院40周年庆祝会。继往开来，将继续以繁荣中国高等教育学术，建设国际化的一流的高等教育研究机构为目标，不忘初心、砥砺前行，为培育高等教育研究和实务英才、发展中国高等教育理论、建设一流的高等教育智库作出新的贡献。