巢湖临床医学院于2014年8月随着学校临床医学院体制改革而正式设立，巢湖临床医学院是由巢湖临床医学院学生党总支(在校本部)与安医大附属巢湖医院(在巢湖)组成，是安徽医科大学最有传承、最具青春朝气的学院之一，下辖精神医学系、全科医学系、医学心理学系，开设临床医学（农村免费定向）专业、精神医学专业。

巢湖临床医学院学生党总支在安医大校本部，主要承担着学院临床医学（农村免费定向）专业、精神医学专业两个专业类型五年制本科生的日常管理和党务、思想政治教育工作以及CSC留学生的教学管理工作。

党总支目前有在编人员5人，专职辅导员2人、兼职辅导员2人、兼职班主任11人；现有在校生478人，其中临床医学（农村免费定向）257人、精神医学专业209人、CSC留学生4届12人。已有5届322名临床医学专业学生顺利毕业，顺利进入临床规范化培训阶段（首届毕业生已走向工作岗位）。

学生在校期间获得大学生互联网+大学生创新创业大赛、大学生创新创业创新训练计划、大学生职业规划设计大赛暨大学生创业大赛、安徽省百万大学生百所高校创意创新大赛以及大学生“挑战杯”课外科技作品和创业大赛等省级以上奖励近20项。