为了适应民航业对安全领域系统研究和高级管理人才培养的需求，在民航总局的支持下，2002年中国民航学院集中全校从事安全管理及技术研究的优势资源，组建了安全科学与工程学院。

安全学院开设了中国民航安全领域第一个也是唯一一个《安全技术及工程》硕士点，并开设了安全工程、公共事业管理本科专业，2015年增设应用心理学专业。硕士点及本科专业均获得了考生和民航企事业单位的普遍认可。特别是，安全技术及工程硕士点自开始招生以来，无论从第一志愿报考人数到考生质量一直名列民航学院各硕士点之首。

2016年中国民航大学院系调整，安全学院被撤销，下属的公共事业管理专业调整至法学院；安全工程专业调整至经济与管理学院；应用心理学本科专业、安全技术及工程硕士研究生专业被调整飞行技术学院。