船舶工程学院前身系1953年创立的“中国人民解放军军事工程学院（哈军工）”海军工程系造船科。目前已经成为我国船舶工业、海军装备和海洋开发领域科学研究与人才培养的重要基地。2017年，船舶与海洋工程学科入选“双一流”学科，并在国家第四轮学科评估中获评A+。

学院设有“船舶与海洋工程”“港口航道与海岸工程”2个本科专业，其中“船舶与海洋工程”专业为国家级特色专业、国家级综合试点改革专业、国家级卓越工程师计划试点专业、国家级工程实践中心、国防重点专业、黑龙江省重点专业，“港口航道与海岸工程”专业为黑龙江省重点专业。具有“船舶与海洋结构物设计制造”“流体力学”“港口、海岸及近海工程”“工程力学”“一般力学与力学基础”“水力学及河流动力学”6个硕士学位授予权，具有“船舶与海洋工程”和“力学”2个一级学科博士学位授予权，具有“船舶与海洋结构物设计制造”“流体力学”“工程力学”“一般力学与力学基础”4个二级学科博士学位授予权，设有“船舶与海洋工程”“力学”2个博士后科研流动站，其中船舶与海洋学科为国家级重点学科。

学院人才队伍中有中国工程院院士1人，国家、省部各项人才计划入选者包括：长江学者青年学者1人，龙江学者6人，新世纪优秀人才3人，优青1名，省杰青2人，青年拔尖人才2人，511人才1人，9人次获评国家、省部级优秀教师。全院现有专任教师129人，其中正高级职称37人，副高级职称68人；博士生导师43人，硕士生导师113人；另有柔性教授16人。

在水下机器人技术、新船型开发及船舶设计、船舶与海洋工程流体力学、船舶与海洋工程结构力学、深海工程、海洋能开发、港口航道工程等方面，学院科学研究工作在该领域具有领先水平并拥有众多标志性成果。

学院设有海洋运载器技术研究所、海洋工程技术研究所、舰船与海洋平台总体技术研究所、船舶与海洋工程流体力学研究所、船舶与海洋工程结构力学研究所、船舶与海洋工程实验中心6个基层学术组织，拥有水下机器人技术国家重点实验室、船舶与海洋工程国家级实验教学示范中心、多体船技术国防重点学科实验室、船舶与海洋工程力学国际联合研究中心、船舶与海洋工程国家级实验教学示范中心等国家级平台。

学院与国外30多所国际知名大学、10多家国际研究机构有着紧密合作，国际六大船级社及多家国内外造船企业、研究院所在学院设立专项奖学金。